衝撃的なラストシーンで幕を閉じた第１期から6年後、  　　選別者にとって狭き門である20階に居たのは、  　　何度脱落しても「塔の王になる」と挑戦を続ける男・王野 成おうじ なる。  　　莫大な受験料のために借金を抱える王野は、  　　最後のチャンスとして再び試験に挑戦し、  　　そこで圧倒的な強さを持つ謎めいた長髪の男・ビオレと出会うが、  　　ビオレは塔の支配者であるザハードに対抗する犯罪組織  　　「ＦＵＧ」のスレイヤー候補であった。

缺乏自信、无人关注的现代学渣少女黎萌萌（李子璇 饰），一脚踏空误入陌生时空——祁国，变成一名神使，现代成绩吊车尾的她在祁国成功逆袭，成为年轻的腹黑皇帝祁炎（陈靖可 饰）的导师，两人默契搭档，合力搞事业。

击败终极歼灭者后，海阳博士为帮助众人返回现世空间而启动聚核基因石，却不慎引起能量爆炸。爆炸的基因石碎片进入了不同的空间缝隙，引起空间缝隙能量失衡，导致大量时空异常现象出现。为避免时空交错，引发空间混乱，海澄与变形联盟四位成员开始寻找并修复出现的空间缝隙。而另一边，浩肯星一方也派出精锐部队来到地球，旨在抢夺基因石碎片能量，消灭变形联盟。面对修复空间缝隙的艰巨任务，面对来自浩肯星的新的敌人和威胁，海澄和变形联盟成员毫不退缩，全力以赴。他们凭着过人的机智，同伴间的信赖，以及面对强敌的勇敢无惧，粉碎了敌人的一系列行动计划，击倒了强大的对手，最终守护了时空的平衡与地球的和平

故事发生在未来世界的一个海边城市，主人公小宏是一名运动健将，无论什么球类都玩得出色。小宏的妈妈经营着一家包子店，一 天放学后，小宏来到店里吃香喷喷的包子，然后帮助妈妈整理仓库。无意中，小宏发现了一颗神秘的小珠，可却引来坏人前来抢夺，想 要用小珠的力量实现野心，此时，一个有生命的迷你车变成神奇的伙伴，帮助小宏赶跑了坏家伙。小宏得知，妈妈曾经和它一起守护城 市，可是却意外失去了记忆。为了帮助妈妈找回记忆，小宏出发寻找神秘的珠子，并和伙伴们一起成为保护城市的小英雄。

小咖带领神奇的咖宝伙伴再次出发，一起守护时空。在这一季中，来自宇宙的外星人们带来全新的危机与挑战，它们偷走红色制造城市大乱、吸收海水严重影响生态、抢夺动物危害自然生命，还为了得到黄金而夺走人类的各种资源，甚至还与捣蛋兄妹结盟四处作乱，小咖和咖宝们每一次都果断出击，化解各种危机，他们又回到过去拯救远古生命、维护时空稳定，对付偷猎者、盗窃集团、诈骗分子和黑心商人，以及守护人们、动物们的安全和快乐，时刻保卫身边世界的和平与安宁。